유전자 분석 - sequencing을 이용한 ADH와 ALDH2의 유전자형 분석과 polymorphism 발굴
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작성일 23-02-05 21:46
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준비된 DNA는 그 양이 많지 않기 때문에 primer를 만들어줘 필요한 부분(ALDH2가 들어있는 약 135bp size로 만들 수 있는)이 들어가게 해주고 tochdown PCR을 실행한다. 마지막으로 두 band 모두 나타나는 것은 heterotype으로서 ALDH2(Glu/Lys)을 의미하게 된다.
유전자 분석 - sequencing을 이용한 ADH와 ALDH2의 유전자형 분석과 polymorphism 발굴
다.
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이번 실험은 사람의 DNA에서 특정 유전자(ADH, ALDH2)에 대하여 유전적 기능을 특징짓는 SNP를 RFLP를 통해 확인하고 sequencing을 통해 정확한 sequence를 찾아내어 여러 sample DNA들을 Data base의 reference와 비교 분석해보는 실험이었다. 그 후, 제한효소와 하룻밤동안 충분히 reaction 시켜준 뒤, 4% agarose gel에 전기영동시켜주면 3가지 형태의 band가 나오게 된다. 여기서 큰 size의 band만 뜬 것은 ALDH2(Lys/Lys)을 뜻하는 것으로 제한효소에 의해 잘리지 않았다는 것을 의미하며 작은 size의 band만 뜬 것은 ALDH2(Glu/Glu)를 의미하는데, 이것은 두 DNA가닥이 모두 제한효소에 의해 잘렸기 때문인 것이다.
ntroduction
설명
유전자 분석,sequencing,ADH와 ALDH2의 유전자형 분석, polymorphism
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이번 test(실험) 은 사람의 DNA에서 특정 유전자(ADH, ALDH2)에 대하여 유전적 기능을 특징짓는 SNP를 RFLP를 통해 확인하고 sequencing을 통해 정확한 sequence를 찾아내어 여러 sample DNA들을 Data base의 reference와 비교 분석해보는 test(실험) 이었다. 먼저 18개의 준비된 sample DNA들은 RFLP를 이용해 ALDH2 유전자가 들어있는 DNA 부분에 대해 제한효소(MboⅡ)를 반응시켜줘 제한효소가 반응하는 site에 존재하는 SNP를 확인했다. 여기서는 Glu를 포함한 DNA만 잘리기 때문에 두개의 Band가 순서로 뜨게 되는 것이다. 먼저 18개의 준비된 sample DNA들은 RFLP를 이용해 ALDH2 유전자가 들어있는 DNA 부분에 대해 제한효소(MboⅡ)를 반응시켜줘 제한효소가 반응하는 site에 존재하는 SNP를 확인했다. 인간의 유전체는 총 30,000-35,000개의 유전자(gene)로 구성되어 있다고 추정되는데, 이 유전자들은 거의 모든 종류의 세포에 존재하는 두 쌍(총 46개)의 염색체
